5. Folderstructuur

5.1 Introductie

Net zoals het bij het datamodel is het belangrijk dat er een eenduidige folderstructuur aangehouden wordt voor de werking van het model. In de configuratie wordt per ziekenhuis aangegeven waar het model naar de data moet zoeken. De data folder zelf hoest dus niet op een bepaalde standaard plek op de server klaargezet te worden. Echter, binnen de data folder houden wij een standaard structuur aan. De folderstructuur die binnen de datafolder wordt verwacht wordt hieronder beschreven en getoond.

5.2 AIOC bestandsstructuur

Hier kan je informatie vinden over welke folder structuur het model verwacht en waar je de resultaten op kunt halen.

Lokale data management overzicht

De bestanden aangeleverd door het ziekenhuis komen binnen in een map aanleveringen per aanlevering. De resultaten van het model kunnen vanuit de map epd_output opgehaald worden en ingelezen worden in het EPD.

5.4 Folders

AIOC_DATA

De hoofdmap voor alle data m.b.t. het project AI ondersteund coderen. Hierin zal een submap komen voor dagopnamen en klinische opnamen.

dagopnamen

De hoofdmap voor alle dagopnamen data. Hierin worden de aanleveringen, coderingen en epd_output mappen aangemaakt.

aanleveringen

In deze map levert het ziekenhuis de bestanden aan per aanlevering. Elke map dient behouden te blijven om aanleveringen te kunnen vergelijken en als back-up te fungeren. De naamgeving van de aanleveringen volgt de conventie [exportdatum]_[startjaarmaand]_[eindjaarmaand], wat inzicht geeft in het moment van klaarzetten van het exportbestand en de periode van de aangeleverde dagopnamen. Deze conventie maakt het mogelijk om onderscheid te maken tussen meerdere aanleveringen over dezelfde periode en aanleveringen die op dezelfde datum zijn geëxporteerd. Indien slechts een deel van een maand wordt aangeleverd, dan moet de gehele maand toch in de naamgeving worden opgenomen. Bijvoorbeeld, voor een gedeeltelijke aanlevering binnen de maand januari t/m maart 2023, wordt de naamgeving [20230101]_[202301]_[202303].

coderingen

In deze map maakt de AIOC applicatie een werkmap aan waar onder andere een kopie van de aangeleverde data, checkpoint bestanden en resultaten komen te staan. Dit is vooral een werkmap voor de data scientisten.

epd_output

In deze map worden de uiteindelijke resulten/output bestanden klaargezet. Deze bestanden kunnen direct in het EPD geïmporteerd worden.

latest

In deze map wordt het laatste outputbestand van de AIOC applicatie geplaatst. Het bestand in deze map kan gebruikt worden om de resultaten te importeren in het EPD.

TRAIN_DATA (alleen voor trainingsziekenhuizen)

In deze map worden de trainingsdata opgeslagen. Deze map is alleen voor trainingsziekenhuizen en bevat data van meerdere jaren met ICD-10 codering om het model te trainen.

5.5 Aanleverbestanden vereisten

In een aanleveringsmap zit 3 type bestanden:

• opnames

• verrichtingen

• documenten (Kan samengevoegd of los per document type aangeleverd worden)

De bestanden dienen als csv aangeboden te worden met een UTF-8 encoding en gebruiken als delimiter ofwel een komma (,) of een semikomma (;). De applicatie kan de bestanden anders niet goed inladen.